CONTRIBUTION AU GENOTYPAGE DE LA POPULATION OVINE D’ALGERIE

Abstract

الملخص في إطار دراسة التنوع الحيوي للموارد الحيوية للأغنام، قمنا بدراسة التوصيف الجيني لهذه السلالات .ان تحديد التوصيف الجيني لأي فصيلة يسمح بمعرفة صفاتها المظهرية و الإنتاجية. لهذا فان الدراسة الإنتاجية اعتمدت على التوصيف المظهري لسلالات الأغنام من جهة و ذلك باستعمال قياسات الجسم و العلامات الإنتاجية لـ 430 من الأغنام للسلالات التالية (أولاد جلال ، الرنبي، الحمرا ، البربر والبربرين) و من جهة أخرى قمنا بدراسة المميزات الإنتاجية للحوم و الحليب و ذلك عن طريق استعمال مقاييس وفقا للمعايير الدولية لـ 81 فرد من سلالة أولاد جلال لتحديد الوزن باستخدام قياسات الجسم و رصد المكسب المتوسط اليومي لدى 105 حمل. في حين اعتمدت الدراسة الوراثية على التوصيف الجيني من خلال دراسة التعدد الجيني للمورثة PRNP المميزة لمرض ارتجاف الأغنام لـ 213 عينة من ثمانية سلالات. و قد كشفت الصفات القياسية تفوق واضح لسلالة أولاد جلال في جميع الصفات المدروسة. في حين دراسة الصفات المظهرية أظهرت تنوع جيني منخفض وغالبية الأغنام بيضاء باستثناء سلالة الحمرا. و في دراسة المميزات الإنتاجية, يمكن تقدير وزن الجسم باستعمال مقياس خطي بسيط, و يعتبر محيط الصدر أفضل مقياس لتحديد الوزن و هذا ما أكده الصيغة : PV=57.9*TP3 . وبالإضافة إلى ذلك، رصد المكسب المتوسط اليومي دل على انخفاض إنتاجية القطيع و يرجع ذلك الى معدل الوفيات و إدارة التربية الحيوانية. و في دراسة التعدد الجيني للمورثة PRNP لدى 8 سلالات من الأغنام (أولاد جلال، حمرا، الرنبي، البربر ، البربرين ، تازقزاوت، تاعظميت و سيداون) قمنا بتحليل 213 عينة حيث أشارت إلى وجود تكرار عالي للأليلات المرتبطة بمقاومة مرض ارتجاف الأغنام (, ARQ, AR143RQ ARQK176 ) مع غياب VRQ المرتبط بالقابلية للمرض. وبالإضافة إلى ذلك، تم العثور على أليلات جديدة لأول مرة لدى الأغنام (N103K، M137I، I142M). كما أن هذه السلالات تظهر تنوع جيني كبير على مستوى رموز أخرى عدى تلك المتعلقة بالمرض. قد كشفت شجرة مصفوفة البعد الوراثي وCluster وجود قرب وراثي بين أولاد جلال و تاعظميت, و بين الرنبي و البربر و أخيرا بين حمرا و سيداون. في هذا الملف قمنا بتحليل هذه النتائج و مناقشتها. -------------------------------------------------------------------------------. Résumé Dans le cadre de l’étude de la biodiversité des ressources génétiques ovines, notre étude concerne le génotypage des races ovines algériennes. Le déterminisme génotypique d’une population suppose la connaissance préalable de sa caractérisation phénotypique et de ses performances. A cet effet l’approche zootechnique aborde d’une part l’aspect phénotypique pour la caractérisation des races, par l’utilisation des mensurations corporelles et des indices zootechniques (sur 430 ovins de race Ouled Djellal, Rembi, Hamra, Berbère et Barbarine), et d’autre part l’aspect performances à viande et laitières. Ce dernier volet concerne les mesures selon les normes internationales chez 81 animaux de race Ouled Djellal, et par l’enregistrement du GMQ chez 105 agneaux. Quant à l’étude génotypique, elle concerne l’analyse du polymorphisme génétique du gène PNRP de la tremblante du mouton sur 213 échantillons de huit races. La caractérisation barymétrique a permis de révéler une nette supériorité de la race Ouled Djellal pour tous les caractères étudiés. Alors que l’étude des caractères phénotypiques montre une faible diversité génétique, excepté pour la Hamra. L’estimation du poids vif est basée sur l’application de la formule PV=57,9*TP3 utilisant le tour de poitrine. De plus, le contrôle du GMQ indique une faible productivité du troupeau qui est relative au taux de mortalité et la conduite d’élevage. L’étude du polymorphisme à la PRNP chez huit races ovines (Ouled Djellal, Hamra, Rembi, Berbère, Barbarine, Tazegzawt, Taadmit et Sidaou) en utilisant 213 échantillons indique que ces races ont des fréquences élevées des allèles de résistance à la tremblante (ARQ, AR143RQ et ARQK176) avec l’absence de l'haplotype VRQ qui est lié la sensibilité à la tremblante. De plus, des nouveaux polymorphismes N103K, M137I, I142M ont été décrits pour la première fois chez les ovins. Ces races présentent aussi une diversité génétique considérable au niveau des codons autres que ceux liés à la sensibilité à la maladie. L’arbre phylogénétique, ainsi que l’analyse de Cluster ont permis de révéler une approche génétique étroite entre la race Ouled Djellal et Taadmit, entre la race Berbère et Rembi, et enfin entre la race Hamra et Sidaou. Ces résultats sont analysés puis discutés.

------------------------------------------------------------------- Abstract As part of the study of the biodiversity of animal genetic resources in sheep, our study is based on genetic studies of Algerian sheep breeds. The genotypic determinism of population presupposes the prior knowledge of its phenotypic characterization and its performances. For this purpose, the zootechnical approach addresses firstly the phenotype to better characterize these breeds by the use of body measurements and zootechnical indexes (for 430 animals of Ouled Djellal, Rembi, Hamra, Berbere and Barbarine breeds) and secondly the production performance by estimation of live weight in 81 animals (case of the Ouled Djellal breed) and the study of ADG (Average Daily Gain) in 105 lambs. The genetic study is based on the determination of the polymorphism at the gene PRNP (scrapie) from 213 samples of eight sheep breeds. The morphometric characterization revealed a clear superiority of the Ouled Djellal breed for all the traits studied. While the study of phenotypic characteristics shows low genetic diversity and the majority of the population is white except for Hamra. For the performances studied, the live weight can be estimated by a simple linear measurement, the chest girth is the best measure to estimate the weight, which was confirmed by the formula BW=57.9*HG3. In addition, the control of ADG indicates a low dairy productivity which is related to mortality rate and livestock management. The study of PRNP polymorphism in eight sheep breeds (Ouled Djellal, Hamra, Rembi, Berbere, Barbarine, Tazegzawt, Taadmit and Sidaou) using 213 samples showed the presence of high frequencies of the haplotypes associated with scrapie resistance such as ARQ, AR143RQ and ARQK176. The VRQ haplotype, associated with higher susceptibility to scrapie, was absent in all Algerian breeds studied. In addition, new PRNP polymorphisms N103K, M137I, I142M are described for the first time in sheep. These breeds have a considerable genetic variability in codons other than those linked to scrapie susceptibility. The phylogenetic tree and Cluster analysis defined a similarity genetic between Ouled Djellal and Taadmit, between Rembi and Berbere and finally between the Hamra and Sidaou breeds. These results were analyzed and discussed.