Etude par modélisation moléculaire de l’effet inhibiteur de quelques composés organiques sur les bactéries

Abstract

In thisresearch, Ourmain goal was to deepenourunderstanding of the mechanisms by whichinhibitors affect bacteria. To do this, weundertook a comprehensivestudyusing an approachbased on molecularDocking, a molecularmodeling technique recognized for itsability to accurately model interactions betweentargetproteins and ligands. As part of our investigations, we chose triazacyclohexane as a ligand, motivated by itsinhibitorypotential. By simulatingitsbehavior and analyzingits interactions with the targetproteinpresent in bacteria, wewere able to calculate the energyassociatedwiththese interactions and closely monitor the bonds formedbetweenthem. This processallowed us to reveal crucial information about the mode of action of this compound and to deepenourunderstanding of the molecular interactions involved in bacterial inhibition. ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- في هذا البحث، كان هدفنا الرئيسي هو تعميق فهمنا للآليات التي تؤثر بها المثبطات على البكتيريا. وللقيام بذلك، أجرينا دراسة شاملة باستخدام نهج يعتمد على الالتحام الجزيئي الذي هو احد أساليب النمذجة الجزيئية، المعروف بقدرته على صياغة التفاعلات بين البروتينات والروابط بدقة. كجزء من تحقيقاتنا، اخترنا [ثلاثي سيكلوهكسان] باعتباره يجند، بدافع من إمكاناته المثبطة. ومن خلال محاكاة سلوكها وتحليل تفاعلاتها مع البروتين المستهدف الموجود في البكتيريا، تمكنا من حساب الطاقة المرتبطة بهذه التفاعلات ومراقبة الروابط المتكونة بينها عن كثب. أتاحت لنا هذه العملية الكشف عن معلومات مهمة حول طريقة عمل هذا المركب وتعميق فهمنا للتفاعلات الجزيئية المرتبطة بتثبيط البكتيريا. --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dans cette recherche, notre objectif principal était d'approfondir notre compréhension des mécanismes par lesquels les inhibiteurs affectent les bactéries. Pour ce faire, nous avons entrepris une étude exhaustive en utilisant une approche basée sur le docking moléculaire, une technique de modélisation moléculairereconnue pour sa capacité à modéliser avec précision les interactions entre les protéines cibles et les ligands. Dans le cadre de nos investigations, nous avons choisi le triazacyclohexane comme ligand, motivés par son potentiel inhibiteur. En simulant son comportement et en analysant ses interactions avec la protéine cible présente chez les bactéries, nous avons pu calculer l'énergie associée à ces interactions et suivre de près les liaisons formées entre elles. Ce processus nous a permis de dévoiler des informations cruciales sur le mode d'action de ce composé et d'approfondir notre compréhension des interactions moléculaires impliquées dans l'inhibition bactérienne.